本文为实现对马匹进行亲缘鉴定及个体识别,基于STR分型技术建立了一套包含 20 个STR基因座和 1 个性别识别位点的复合扩增体系,并对其进行性能评价以及实际样本扩增测试.应用荧光标记技术,选择 HTG06、HTG07、COR022、CA425、HTG04、COR082、LEX54、COR069、AHT05、HMS03、HMS01、HMS06、HMS07、COR058、HTG10、ASB17、VHL20、HMS02、ASB02、LEX34、Amelogenin共 21 个遗传标记,进行引物设计、PCR复合扩增、CE平台测序,验证该体系的灵敏度、特异性及耐受性.对128 份实际样本进行检测以及亲缘关系比对,并对其中的66 份未知亲缘关系的样本基因做多态性统计.结果显示:该复合扩增体系检测128份马样本能够获得完整STR分型,在实际扩增中,无非特异峰产生,对于不同种属动物,例如牛、羊、猪、鸡、猫、狗、人DNA样本扩增时不出现特异性扩增峰;0.075 ng马标准品在 10 μL体系下仍可以获得完整分型;对于 4种常见抑制剂的耐受性可以分别达到血红素200 μmol/L、血红蛋白 200 μmol/L、腐殖酸 100 ng/μL、EDTA 1.2 mmol/L.本研究建立的马STR复合扩增体系分型准确、性能优,可满足实验室对马匹亲权关系鉴定和个体识别的需求.